在初中阶段，生物和地理两门科目的学分计算通常与学生的平时表现、期中期末考试成绩以及作业完成情况有关。

首先，平时表现包括课堂参与度、作业提交情况、实验操作等，这些都会根据学校规定给予一定的学分比例。其次，期中期末考试是衡量学生学科知识掌握程度的重要方式，其成绩会占据较大的学分比例。最后，作业完成情况也是学分计算的一部分，如定期的书面作业、实验报告等。具体学分的分配比例会根据学校的教学大纲和评分标准有所不同，但总体上，这三部分共同构成了生物和地理学科的学分评定体系。