厦门市共有两所一本大学，分别是厦门大学和华侨大学。

厦门大学，简称“厦大”，是中华人民共和国教育部直属的综合性重点大学，是国家“211工程”、“985工程”重点建设的高水平大学之一。它是中国最早开展研究生教育和学位授予单位之一，被誉为“南方之强”。华侨大学，简称“华大”，是中央统战部直属的综合性重点大学，是国家重点建设的综合性大学之一。学校以“面向海外、面向港澳台”为办学方针，致力于培养具有国际视野和创新精神的人才。