南京房产过户给外地姐妹的流程如下：去南京市住房保障和房产局进行申请并提交相关材料，包括身份证、房产证、姐妹关系证明等。

提交的材料被受理后，会进行房产评估。提交的资料通过审核后，即可办理过户手续，并缴纳相关税费。完成过户手续后，会发放新的房产证。需要注意的是，南京市对于外地户籍居民购房有相关限制，需要满足一定的条件才能购买。同时，在办理过户手续时，需要缴纳的税费也根据房产的评估价值而定。在办理过户之前，建议先了解相关政策和规定，以免出现不必要的麻烦。