小龙虾养殖的消毒步骤主要包括：

1. 池塘清理：在放养虾苗前，彻底清除池底淤泥并进行暴晒，以杀灭病原菌和寄生虫。

2. 水体消毒：使用生石灰或氯制剂对水体进行消毒处理，杀死有害微生物。

3. 虾苗消毒：将购进的虾苗用3%的盐水浸泡5-10分钟，以去除体表病原体。

4. 饲料消毒：投喂前，将饲料置于阳光下暴晒或使用消毒剂处理，防止带入病原。

5. 定期监测：定期对养殖水体进行水质检测，确保各项指标符合养殖要求。

6. 疾病预防：根据季节变化和养殖情况，适时投放预防性药物，减少疾病发生。通过以上措施，可以有效控制小龙虾养殖过程中的病原传播，保障养殖成功。