自生稻与普通水稻有以下几个主要的差别：

1. 生长环境：自生稻通常生长在自然河流或湖泊周围的湿地环境中，这些环境具有较高的湿度和水分供应。

相比之下，普通水稻通常种植在人工灌溉的稻田中，通过人工供水来维持稻田的湿润程度。

2. 生长习性：自生稻能够适应较为恶劣的自然环境，如水位波动、泥沙淤积等。它们有更强的适应能力，对环境适应性强。普通水稻则更适合在稻田中栽培，需要更稳定的水源和土壤环境。

3. 植株特征：自生稻的植株较为矮小，叶片也相对较小，适应在湿地环境中生长。而普通水稻的植株一般较高且茂盛，具备较大的叶片和稻穗，适合在稻田中高产。

4. 产量与耐病性：普通水稻经过长期的选育和改良，具备较高的产量和较好的抗病能力。而自生稻由于生长环境的特殊性和野生品种的特点，其产量通常较低，也缺乏抗病能力。自生稻在研究和保护野生植物资源方面具有重要的意义，对于保护生物多样性和探索潜在的农作物基因资源具有重要的价值。普通水稻则是全球最主要的粮食作物之一，是人类重要的食物来源之一。