碳骨架异构可以通过NMR谱和红外光谱来观察和判断。

其中NMR谱可以通过碳的化学位移和耦合常数来判断有机物分子中的碳原子在空间上是如何排列的；红外光谱则可以观察有机物分子中的碳-碳键和碳-氢键的振动情况，根据振动频率的不同来判断碳骨架的异构。此外，还可以通过X射线衍射和质谱等方法来进一步确认分子的异构体结构。