在南京，如果初中生在物理科目中未能通过考试，通常可以在下一个学期初参加补考。

补考的具体安排和流程一般由所在学校的教务处负责通知和安排。学生需要密切关注学校的通知，了解补考的报名时间、地点以及所需携带的相关证件（如学生证）。在准备补考的过程中，学生应认真复习物理课程的内容，特别是之前考试中未能掌握的部分。可以请教老师或同学，多做练习题，提高解题能力和应试技巧。同时，保持良好的心态，相信自己能够顺利通过补考。