北京交通大学是交通大学的三个源头之一，历史渊源可追溯到1896年，前身是清政府创办的北京铁路管理传习所，是中国第一所专门培养管理人才的高等学校，是中国近代铁路管理、电信教育的发祥地。

1921年参与合并组建交通大学；1923年更名为北京交通大学；1970年恢复使用“北方交通大学”校名；2003年恢复使用“北京交通大学”校名。