蚯蚓养殖中的寄生虫主要有绦虫、线虫、簇虫和寄生蝇类，主要采取以下措施进行防治：1、畜禽粪便必须充分腐熟、发酵，借助高温杀死粪便中寄生虫卵和幼虫。

2、蚯蚓饲养场要建立产品检验制度，防止带寄生虫的蚯蚓产品出厂；未经检验合格，不可随便引种，以免寄生虫蔓延。

3、畜禽饲养场的工作人员要注意畜禽的饮食卫生，定期对畜禽进行普查，发现有寄生虫的畜禽，应及时进行治理，或采取隔离饲养等措施。