农村两层房的装修费用因地区、材料选择、装修风格和施工队伍等因素而异。

一般来说，基础装修（包括水电改造、墙面处理、地板铺设等）可能在每平方米500-800元之间，这取决于使用的材料和施工质量。如果加上家具、家电、门窗、灯具等，总成本可能会上升至每平方米1000-1500元。因此，对于一套100平方米的两层房屋，装修费用可能在5万至15万元之间。建议联系当地的装修公司或施工队进行详细咨询和报价，以便获得更准确的预算。