含有一个结合ATP的盒式结构域、在长期进化中形成的高度保守的一大基因家族编码的一类跨膜蛋白。

真核生物的ABC转运蛋白的肽链基本结构是按N端-MSD1-MBD1-MSD2-NBD2-C端顺序排列的，跨膜结构域含有12个与结合ATP相关的α螺旋。已知有机体中有1000余种不同的转运蛋白，它们可转运的底物包括无机离子、单糖、聚糖、胆固醇、磷脂、氨基酸、肽、蛋白质、毒素、药物、抗生素和异源物质等。