脑干居于脑的"中心"，上擎大脑，背负小脑，下连脊髓。

肩负着小脑、脊髓与大脑的三者的相互联系。同时也是除嗅神经和视神经之外所有脑神经的出入之处。此外，人体的呼吸中枢、心跳中枢、睡眼中枢及意识中枢等均位于脑干。因此，脑干是神经系统的中心枢纽，是生命的基本中枢所在。