一般的军事院校隶属关系相对复杂。

通常的初级指挥和技术院校都是隶属于总参谋部的军训部院校局，而政治院校归总政管理，后勤类和军医大学归总后。目前个别的技术院校隶属于总装（为数很少）。但是，也有个别特殊的院校是从属于相关的总参某些对口部门的。国防大学和军事科学院都是大区级单位跟总参几乎平行，所以一般是直接隶属于军委的。