高温，过酸，过碱只能破坏蛋白质的空间结构，无法使肽键断裂，变性作用是蛋白质受物理或化学因素的影响，改变其分子内部结构和性质的作用。

所以，蛋白质变性的原因不是肽键被破坏。一般认为蛋白质的二级结构和三级结构有了改变或遭到破坏，都是变性的结果。能使蛋白质变性的化学方法有加强酸、强碱、重金属盐、尿素、丙酮等；能使蛋白质变性的物理方法有加热(高温)、紫外线及X射线照射、超声波、剧烈振荡或搅拌等。因此蛋白空间结构被破坏不一定会破坏肽键.例如把鸡蛋煮熟的过程就不会破坏肽键.