东南大学标志整体图案呈圆形，由两个同心圆组成。

外环线条用外粗内细“文武线”装饰，体现了中国的传统文化。外环上半部分为东南大学英文名称“SOUTHEASTUNIVERSITY”，下半部分为集王羲之书法体校训“止于至善”。校标的颜色选取黄色和绿色。外环和大礼堂为黄色，三角形内大礼堂背景为绿色。黄色是中国的传统色，同时也表明该校校址曾是六朝皇宫内苑和国子监所在地。绿色喻意青年学子风华正茂，代表六朝松历经千年仍然生机勃勃旺盛生命力，同时表明该校位于长江之滨、玄武湖畔。校标设计紧凑合理，漂亮大方。