木棉提举司是元中央设立的一个专管棉花种植、棉布生产等的一个机构。

木棉提举司，官署名。元置。掌木棉的种植与征收。至元二十六年(1289年),桑哥任平章政事时,在浙东、江西、湖广、江东、福建等地设置木棉提举司。每年向民间征收木棉10万匹。桑哥败后,各处的木棉提举司遂被罢除。