从水资源方面分析，它具有流动性、随机性、易污染型、利害两重性等不同于其他自然资源的特有属性。

在用水户属性上分析，从平面位置上，它们分布在河流的上下游、左右岸甚至跨流域；从用水时间上，他们可以是现在的用水户，也可以是将来的用水户；从用水户的性质上，他们可以是人口、工业、农业、生态环境等；从用水的主体上，它们可以是自然人、社会法人、社会组织、社会公众（如生态环境用水）等。这些属性决定了水资源分配方式较其他自然资源的分配方式更复杂。现阶段，水资源配置时一般原则：时问上的优先顺序为现状用水户、潜在用水户（将来增加的需水量）；在空间上的优先顺序为先上游、后下游，先本流域后外流域；用水产性质的优先顺序为生活用水、生产用水、生态环境用水。按照上述原则分配水资源有其局限性，表现为：外流域现状用水户对本流域潜在用水户的用水影响，上游潜在用水户对下游现状用水户的用水影响，生态环境用水不足造成的生活和生产上有水无用的影响。