首先是光反应阶段：天线色素（叶绿素a,b，叶黄素等）吸收光能，传递给反应中心（一对叶绿素a），反映中心的chl被激发为chl*,chl*放出电子给NADP，将NADP还原为NADPH，自己变为chl+，chl+接受一个来自H2O的电子，重新变为chl准备下一次重新利用。

在光反应中，植物首先要把光能转化为活跃的化学能（ATP、NADPH），进而完成暗反应，最终转化为稳定的碳的同化物。叶绿素在两个光合反应中心P680和P700借助光能，使电子在光和膜上逆氧化还原方向传递，其间完成水的光解（释放氧气，向类囊体基质内提供H离子）和光和磷酸化（NADP+的还原为NADPH，并生成ATP，NADPH和ATP都是暗反应的重要原料）。植物有PS1,PS2,Ctyb6f组成电子传递链。ps2,的天线色素吸收光子传递给P680，P680被激发成P680*，然后传递电子给质体醌，经过Q循环传递给Ctyb6f，在传递给ps2的P700，ps2的P700被激发成P700*，释放电子给A1,A2....最后传递给NADP，将NADP还原为NADPH。Ps2也可以吸收光，将P700激发