1、微囊蓝菌属（Microcystis）。

池塘、湖泊中常见的种类。细胞较小，一般为球状，多次分裂产生气泡，许多细胞密集在一起，在一个共同的胶鞘膜中，形成球形胶团，浮游水中。

2、鱼腥蓝菌属（Anabaena）。细胞球形。细菌分裂总是在相平行的面上形成链状丝，链状丝有一层或薄或厚的鞘，在链状丝中有少数细胞形和其他细胞不同。细胞壁明显加厚，称为异形胞。在水中生长，链状丝包在一个共同的胶被中，形成不定形胶块。

3、单歧蓝菌属（Tolypothrix）。相平行的分裂面分裂，形成整齐的有平行的隔腊细胞丝。异形胞长在细胞丝的的顶端，在细胞丝外面有一共同的鞘膜，鞘膜的细胞连在一起形成假分枝。

4、颤蓝菌属（Oscillatoria）。细胞丝由饼状细胞叠垒形成，不分枝，也没有假分枝，没有异形胞。在水中不断颤动，故名。