初中化学实验中，在瓶口塞棉花是为了防止药品中含有的水分和空气中的成分对实验的影响。

棉花是一种多孔性材料，可以有效过滤空气中的颗粒物和水分，从而避免药品受到污染或变质。此外，棉花还能起到防止实验过程中产生的气体外泄的作用，确保实验的安全进行。因此，在初中化学实验中，瓶口塞棉花是一项必要的操作。