福州大学设有19个以全日制本科生和研究生培养为主的学院以及2个独立学院。

现有国家重点学科1个、国家重点（培育）学科1个、国家“211工程”重点学科建 设项目7个、省级优势学科创新平台4个、省级特色重点学科6个、省级重点学科26个。共有博士后流动站11个，一级学科博士点9个、二级学科博士点61 个、一级学科硕士点35个、二级学科硕士点147个、专业学位授权点12个(其中工程硕士专业学位授权点含23个工程领域)。