当客户从货款里扣除赔偿款时，会计处理上可以将其作为营业外支出进行记账。

具体的会计分录为：借银行存款和营业外支出，贷主营业务收入和应交税费-应交增值税-销项税。营业外支出是指除主营业务和其他业务支出以外的各项非营业性支出。在处理营业外支出时，需要设置“营业外支出”账户以进行核算。企业发生各项营业外支出时，记入这个账户的借方，并在期末结转损益时，从贷方转入“本年利润”账的借方，结转后该账户将无余额。对于固定资产的转让，企业需要先结转固定资产原值和已提累计折旧额，借记“固定资产清理”、“累计折旧”科目，贷记“固定资产”科目，并收到双方协议价款，借记“银行存款”，贷记“固定资产清理”科目。最后结转清理损益，若转出价款低于固定资产账面净值，借记本科目，贷记“固定资产清理”科目。当企业处置无形资产时，应按实际收到的金额来进行会计记录，借记“银行存款”等科目。按已计提的累计摊销，借记“累计摊销”科目。按应支付的相关税费和其他费用，贷记“应交税费”、“银行存款”等科目。按其账面余额，贷记“无形资产”科目。按其借方差额，借记“营业外支出–处置非流动资产损失”科目。已计提减值准备的，还应同时结转减值准备。在期末，应将“营业外支出”账户余额转入“本年利润”科目，结转后“营业外支出”账户将无余额。这样，赔偿款就可以作为营业外支出进行记账了。