原子、分子和离子是构成物质的三种基本微粒。它们之间的主要区别有两点：一是原子不显电性，二是原子一般不具有稳定结构，离子一般具有稳定结构。

原子是构成物质的最小微粒，中性，单个原子或者多个原子组成分子，多个分子再形成物质，原子在化学反应中不发生变化。

分子由原子构成，很多单原子分子，原子=分子，例如惰性气体，金属等等。

离子是带电荷的原子或原子团。离子分为正离子和负离子，离子是指原子或原子基团失去或得到一个或几个电子而形成的带电荷的粒子。

原子、分子和离子是化学中不同类型的粒子。

1. 原子（atom）是构成物质的基本粒子，由质子、中子和电子组成。质子和中子位于原子核中，而电子围绕原子核轨道运动。原子是化学反应的基本单位。

2. 分子（molecule）是由两个或更多原子通过共享电子而结合形成的。分子是化学物质的最小化学单位。例如，氧气分子（O2）由两个氧原子通过共享两对电子而结合。

3. 离子（ion）是原子或分子失去或获得一个或多个电子而带有正电荷或负电荷的粒子。失去电子的离子称为阳离子（正离子），带有正电荷；获得电子的离子称为阴离子（负离子），带有负电荷。离子是溶液中电解质的形式。总结起来，原子是构成物质的基本粒子，分子是由原子通过共享电子而结合形成的，而离子是带有电荷的原子或分子。

原子、离子和分子的区别包括性质不同、特性不同、结构不同等。其中，由组成的原子按照一定的键合顺序和空间排列而结合在一起的整体，这种键合顺序和空间排列关系称为分子结构。

化学反应不可再分的基本微粒，原子在化学反应中不可分割，离子是原子由于自身或外界的作用而失去或得到一个或几个电子。使其达到最外层电子数为8个或2个或没有电子的稳定结构。

分子质量和体积都很小分子总是在不断运动着的，温度升高分子运动速度加快分子之间有间隔，一般说来来说气体分子间隔距离较大。液体和固体的分子之间的距离较小。

原子的质量非常小不停地作无规则运动。原子间有间隔同种原子性质相同不同种原子性质不相同。