原子和分子可以从以下几个方面进行区分：化学反应中可再分与不可再分。

在化学反应中，分子可以再分，原子不可以再分。构成方式。分子是由同种或不同种原子通过一定作用力以一定次序和排列方式结合成。体积大小。分子、原子都有体积和质量，但彼此间仍然存在一定间隔，且都是质量极小、体积极小的粒子。微粒性质。同种原子性质相同，不同种原子性质不同；分子也是同种分子性质相同，不同种分子性质不同。