周琦于2016年6月24日参加了NBA选秀大会，并在次轮第43顺位被休斯顿火箭队选中。

经过一段时间的考虑和准备，周琦在2017年7月正式与火箭队签约，并随队参加了夏季联赛。他在2017-2018赛季正式成为火箭队的一员，开启了自己的NBA生涯。