学校前身是1905年创办的复旦公学。

1952年院系调整后，学校成为以文理基础教学和研究为主的综合性大学。

2000年，复旦大学与前身为1927年创办的国立第四中山大学医学院的上海医科大学合并，组建新的复旦大学。截至2020年4月，学校有邯郸校区、枫林校区、江湾校区、张江校区四个校区，占地面积约243.92万平方米，校舍建筑面积224.11万平方米；有直属院（系）35个，附属医院18家（其中4家筹建），设有本科专业79个；有普通本专科生13991人，研究生22232人，留学生2946人；在校教学科研人员3139人。