校徽由篆体“亳”字、芍花、手书“亳州学院”、英文校名及1909等元素组合而成。

“亳”字代表着亳州古老的历史文化。芍花为亳州市花,芍花型背景显示亳州地方特色。手书校名浑厚有力,遒劲沧桑。英文校名采用等线型字体。1909代表着学校悠久的办学历史。标志整体简洁清晰,具有深厚的历史内涵和浓郁的地方特色,且易于识别、传播。