南京985大学有南京大学、东南大学；南京211大学有南京大学、东南大学、南京理工大学、南京航空航天大学、河海大学、南京师范大学、南京农业大学、中国药科大学。

南京大学，简称“南大”，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，位列“世界一流大学建设高校A类”、“211工程”、“985工程”，为九校联盟、中国大学校长联谊会、环太平洋大学联盟、21世纪学术联盟、国际应用科技开发协作网、东亚研究型大学协会、新工科教育国际联盟、中国高校行星科学联盟、长三角研究型大学联盟成员，入选学位授权自主审核单位、“珠峰计划”、“强基计划”、“111计划”、“2011计划”、卓越工程师教育培养计划、卓越医生教育培养计划、卓越法律人才教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、新工科研究与实践项目、全国深化创新创业教育改革示范高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、教育部来华留学示范基地、国家级双创示范基地。东南大学，简称“东大”，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，是国家首批世界一流大学建设高校(A类)、“985工程”和“211工程”重点建设高校，入选“2011计划”、“111计划”、卓越工程师教育培养计划、卓越医生教育培养计划、国家大学生创新性实验计划、国家级大学生创新创业训练计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、全国深化创新创业教育改革示范高校、学位授权自主审核单位，由教育部与江苏省共建。