修路造成商铺损失一般可以通过以下步骤申请赔偿：

1. 保存好证据：发现路政或施工方给商铺造成了损失，第一时间应该记录现场情况，并拍照留证，收集相关证明材料，如发票、公章询证书、交易记录等。

2. 向责任主体提出赔偿申请：通常需要向路政或施工方提出赔偿申请。申请时应提供详细的证据和受损情况，以及要求赔偿的金额、种类等。

3. 调解协商：责任主体会对申请进行调查和审核，对于受理后认定为可以赔偿的申请，往往会先尝试与申请人达成协议，协商赔偿金额和方式等细节问题。

4. 提交赔偿申请：如果在实际协商中无法达成一致，申请人还可以选择向相关行政机关提交赔偿申请，由当地有关部门进行审核和处理。需要注意的是，在处理申请过程中，应尽可能避免出现虚假证据和不实陈述的情况，切勿自行私了，如果无法协商成功，也可以考虑寻求法律援助。