自建房房产证办理流程如下：

1. 准备材料：身份证、户口本、结婚证（如已婚）、土地证或宅基地证明、房屋设计图纸等。

2. 填写申请表：到当地房产管理部门领取并填写《房屋所有权登记申请表》。

3. 提交申请：将申请表及相关材料提交给房产管理部门。

4. 缴纳税费：根据当地规定，可能需要缴纳契税、印花税等相关税费。

5. 现场勘查：房产管理部门会对房屋进行现场勘查，确认房屋是否符合相关规定。

6. 领取房产证：完成上述步骤后，按照通知时间到房产管理部门领取房产证。请注意，具体流程和所需材料可能因地区而异，建议提前咨询当地房产管理部门。