海口科三考场和澄迈科三考场的区别在于地理位置和考试环境。

海口科三考场位于海口市，是海南省的省会，交通便利，考场设施较为完善。而澄迈科三考场位于澄迈县，距离海口较远，交通不如海口便利，考场设施可能相对简陋。此外，考试环境也可能有所不同，海口科三考场可能更加繁忙，考生数量较多，而澄迈科三考场可能相对较少考生，考试环境相对较为宁静。考生可以根据自己的实际情况选择合适的考场报名参加科三考试。