在下雨天，甲鱼塘可以进行一些消毒措施，但是需要小心使用化学品，以免对甲鱼产生不良影响。

下面提供一些可能的消毒方法，请根据具体情况谨慎选择和操作：

1. 紫外线消毒：使用紫外线灯照射水体，可有效杀灭水中的细菌和病原体。

2. 氯消毒：通过添加氯化钠（盐）或次氯酸钠（食用漂白粉）等氯含量较低的化学物质进行消毒。但要确保使用适量的氯消毒剂，充分搅拌水体以保证均匀分布，并在消毒后进行充足的冲洗。

3. 洁净剂消毒：使用一些专门的鱼类治疗和消毒剂，根据产品说明进行使用。这些产品通常是为鱼类而设计，能够杀灭细菌和病原体，同时对鱼只的影响较小。在进行任何消毒操作之前，建议先测试水质参数，确保水质符合鱼类生态要求。此外，要遵循操作指南并注意消毒剂的使用安全，以确保甲鱼的健康和生存。最好在咨询专业兽医或养殖专家之后再进行消毒操作。