南京工业大学制药工程专业属于生物与制药工程学院，学院地址是南京市浦口区浦珠南路三十号，属于南京工业大学的浦口校区。

南工大的制药工程是国家重点学科，主干学科有：药学、生物学、化学、化学工程与技术，特色课程有：药物化学、生理药理学、药剂学等。