DNA和RNA的碱基配对方式是遵循碱基互补配对原则，即A=T，C=G。

在双链DNA分子中，嘌呤碱基总数等于嘧啶碱基总数，各占全部碱基总数的50%；在双链DNA分子中，两个互补配对的碱基之和的比值与该DNA分子中每一单链中这一比值相等；DNA分子一条链中，两个不互补配对的碱基之和的比值等于另一互补链中这一比值的倒数。