遇到自己农房被别人办证，也没啥大不了的。

分两步路走:第一步，到不动产登记部门申请撤销骗取、违规登记的房产证。不动产部门会审查，答复的。第二步，以现在不动产登记部门为被告提起行政诉讼。注意这个是有诉讼时效的。总之，在农村的房产被别人登记，只要证据充分，不管是通过行政诉讼还是通过行政处理途径，基本上都能撤销以前办的证。