合并了，1950年，私立重庆复旦中学改为公立中学。

1954年，重庆复旦中学更名为重庆第十二中学。1995年，重庆第十二中学恢复重庆复旦中学校名。

2002年，复旦大学将重庆复旦中学设为“复旦大学学生社会实践基地”。

2004年，原重庆复旦中学与原重庆市第五十三中学校合并，成立新的重庆复旦中学。

2005年，学校成通过重庆市教育委员会验收，成为重庆市重点中学。

2007年起，复旦大学每年给予重庆复旦中学“校长推荐”指标。

2010年，由复旦大学牵头，重庆复旦中学与上海复旦中学、复旦大学附中(复旦大学附属中学)、台湾复旦中学、上海复兴中学(上海市复兴高级中学)、乌江复旦中学(乌江复旦学校)成立“复旦基础教育联盟”。