地质学专业本专业前身是云南大学1923年建校之初就设有的矿冶系。

后经五十年代院系调整，矿治系独立成其他专业院校的相关专业，如现今的昆明理工大学、长沙矿业学院等。

2008年为适应国家加强地质工作要求，地质学专业单独恢复重建为地质学系。现设有地质学本科专业、地质学一级学科硕士点和环境地质学二级硕士学位点。

2009年正式开始面向全国招收地质学专业本科生；2016年招收环境地质学硕士研究生；2016年12月获准建设地质学一级学科硕士点。