不动产权证原件不会被银行扣留。

如果你办理贷款的话，银行不是扣的房产证(或不动产证)而是他项权证。 房屋他项权证是指在他项权利登记后，由房管部门核发、由抵押权人持有的权利证书。 办理银行贷款，并不是银行把你的房产证收走，而是获得你房子的“他项权利”，也就是从房屋产权登记机关获得《房屋他项权证》。