1、木种不同黄檀木属于是紫草科破布木属的三出破布木，还属于四白绿叶破布木为中至大乔木，而金丝檀木的木材种属非洲的小斑马木，还属苏木科树种中的一种木材。

2、产地不同黄檀木又叫墨西哥黄金檀，产地一般在墨西哥南部，而金丝檀木也叫非洲黄金木，生长于非洲加蓬，喀麦隆等热带雨林地区木材。

3、木材特点不同黄檀木的树皮浅灰色，展现出来的是那种整齐的网状纵横裂纹，内皮红褐色，木材端头为圆形，有的为梅花状，非常的有光泽，纹理交错，材质甚重，而金丝檀木的树皮是灰色的，树皮开裂，条纹脱落，内皮赤褐色，木材是那种淡桃褐色的或者是淡黄褐色的，而且也有金属光泽。