中科大资产经营有限公司是其控股股东。

公司除了提供资金外，主要是依托科大的技术优势，对科大讯飞提供科技支持和人员支持。也就是说科大讯飞是科大的校办企业，但是融合了其他单位的技术资金实力，因为科大讯飞还是很受国家重视的一家有定价权和自主支持产权的一个高科技企业。科大讯飞是股份制公司，虽然控股，但是科大对于讯飞的内部事务并不能干涉。同时科大讯飞出于需要，需要和科大进行科技合作。也就是说，科大讯飞的冠名是因为它开始时科大纯校办企业。学校对它有经营权。但是当讯飞改组为股份制上市公司后，科大对其便没有了经营权，而只拥有股份，和其他协办单位一样。而科大与讯飞的合作也变为市场行为，讯飞对科大的科技有需求，而科大则需要讯飞的经济利益。