当两边有邻居时，为了做独立基础，需要考虑以下几个方面：确定基础位置：在确保不影响邻居房屋结构的前提下，选择合适的位置进行基础施工。

挖掘和排水：进行基础挖掘时，要特别注意不要对邻居的房屋结构造成损害。同时，要确保排水畅通，避免积水对基础造成影响。基础设计：根据房屋结构和邻居房屋的位置，进行独立基础的设计。设计时要考虑到地基承载力、地下水位等因素。施工和防护：按照设计要求进行施工，注意施工过程中的安全和防护措施，避免对邻居房屋结构造成影响。在施工过程中，建议与邻居进行充分沟通，了解他们的需求和意见，共同协商解决方案，确保双方都能满意。