个人申请的工伤赔偿，如果已经完成了劳动能力鉴定，那么，劳动行政部门会将由基金支付的部分，如治疗费，一次性伤残补助金和一次性就业补助金直接支付到用人单位，然后加上用人单位应承担的如一次性就业补助金，停工留薪工资等直接支付给工伤职工。