是的，任天堂Switch和Wii U都支持第三方手柄。

任天堂的主机在设计时考虑到了玩家的需求，因此允许玩家使用第三方手柄。这样一来，玩家可以选择更适合自己的手柄进行游戏，提高游戏体验。当然，玩家在选择第三方手柄时需要注意手柄的兼容性和质量，以确保可以正常使用并且不会影响到游戏操作和性能。总的来说，任天堂支持使用第三方手柄，但是玩家应该进行谨慎选择，以确保获得最佳游戏体验。