中国农业科学院是副部级事业单位，隶属于国家农业农村部。中国农业科学院是新中国三大科学院之一，代表了中国农业科研机构的最高水平，无论是规模、学科还是综合研究实力都位于顶峰，在我国农业农村建设、农业农村经济发展、科技兴农政策、培养高水平农业科技人才以及相关重大问题和决策上发挥着举足轻重的作用。
一、行政级别上
中国农业科学院是副部级直属科研事业单位，隶属于国家农业部管理，院长为副部级干部，副院长为厅局级干部，下设32个研究所的所长为副厅局级。
二、科研级别上
1、国家层面上
作为中国三大科学院之一，农科院代表了中国农业研究的最高水平。十一五以来，农科院示范推广新品种218 个、新产品 130个、新技术290项，示范推广面积5.5亿亩，示范推广畜禽2 .1 亿头（羽），几乎占到了全国的50%。
2、世界层面上
中国作为农业大国，代表国家最高水平的农科院在世界农业领域中同样名列前茅。农科院拥有10个ESI前1%学科，已与38个国际组织、83个国家、7个跨国公司建立了广泛的科技合作关系，组织参加了“国际农业研究磋商组织挑战计划”、“绿色超级稻项目”等一批重大国际科技合作项目。
三、教育级别上
农科院是我国最顶尖的农业科研人才培养殿堂，先后有29 位两院院士在院工作，平均每年培训农民和基层技术人员106万人，累计向国家输送 1 万多名农业科研高层次人才。