3+3大专和五年制大专的区别是含义不同、就读年限不同、就读学校不同。从含义上看，3+3大专是初中生读中专，在中专通过对口升学或单招考试升入国家统招大专，颁发3年全日制大专毕业证，与通过普通高考考入的统招大专毕业证相同；五年制大专又称初中起点大专教育"，招收参加中考的初中毕业生。
一、含义不同
1、3+3大专是初中生读中专，在中专通过对口升学或单招考试升入国家统招大专（考试有一定难度），颁发3年全日制大专毕业证，与通过普通高考考入的统招大专毕业证相同。通过对口升学或单招考试升入大专是可以重新换专业的，专业选择范围广，不过这个考试是有一些难度的（但本校直升有一定优势，比如湖南电子职业科技学院可直升本校大专）。
2、五年一贯制大专，又称初中起点大专教育"，招收参加中考的初中毕业生，是一种新兴的高等教育模式。学制为五年，参加五年一贯制"教育的学生在初中毕业的基础上，用两年补习高中课程，再用三年学习大专课程，在五年的时间里系统学习文化基础课和专业技术课。
参加五年一贯制"教育的学生在学完专业规定课程后，毕业时获得普通高校统招大专毕业证书。此学历为国家承认的全日制大专学历，享受大专毕业生的一切待遇，包括报考国家公务员考试、专升本"考试等等。
二、就读年限不同
1、3+3大专，就读年限是6年。
2、五年一贯制大专，就读年限是5年。
三、就读学校不同
1、3+3大专，如果本校没有大专则不在同一所学校就读。
2、五年一贯制大专是在普通高等大专学院就读，中专和大专都在同一所大专院校完成。