食品药品安全的主要责任主体是食品生产经营企业主要负责人以及食品安全总监、食品安全员等食品安全管理人员。根据《中华人民共和国食品安全法》等法律法规，食品生产经营企业应当建立健全食品安全管理制度，落实食品安全责任制，依法配备与企业规模、食品类别、风险等级、管理水平、安全状况等相适应的食品安全总监、食品安全员等食品安全管理人员，明确企业主要负责人、食品安全总监、食品安全员等的岗位职责。
企业主要负责人对本企业食品安全工作全面负责，建立并落实食品安全主体责任的长效机制。食品安全总监、食品安全员应当按照岗位职责协助企业主要负责人做好食品安全管理工作。
食品药品安全的主要责任主体是食品药品监督管理部门和生产食品、药品生产商。