大学军训不能参加会扣学分。不同学校的具体扣分情况可能有所不同，但一般来说，不参加军训会导致相应的学分丢失。军训在大学教育中具有重要的意义。它不仅是培养学生德智体全面发展的重要途径，还能增强国防意识、集体主义观念和自律能力。
大学生军训免训是否影响学分，取决于学校的具体规定和政策。
在大多数高校中，如果学生因身体原因或其他正当理由获得军训免训批准，通常不会影响学分。学校会根据学生的实际情况，安排其他替代方式来完成相应的学分要求，比如参加军事理论课程的学习、撰写相关论文或参与其他与军事教育相关的活动。
然而，也有一些学校可能将军训作为必修课程，并明确规定必须完成实际的军训训练才能获得学分。在这种情况下，如果没有参加军训且未通过其他替代方式获得学分，就可能会影响到毕业所需的总学分。
所以，建议您在申请军训免训之前，详细了解所在学校的相关政策和规定，与辅导员或教务处老师进行沟通，以确定是否会对学分产生影响。
大学不参加军训的后果：
1、首先很多学校会把大学军训作为一个学分的考核项，并且是单独一项，如果你没有参加大学军训，那么你这项学分是没有的。
2、大学军训并不要求所有学生必须都去，一些有特殊病症的开了病例证明之后是可以不去的，不过如果学校对大学军训很在意的话，一般的病例是没有办法的，就算生病，也要在旁边站着或者坐着。
3、不参加大学军训和逃离军训是两种不同的概念，有的学校会选择在校园内进行军训，如果逃跑了那么就会被视为情节严重的，轻者被导员教育重者直接记处分。
大学军训期间可以请假吗
首先，学生在学校的军训活动是要在保证学生的人身安全的前提下进行的，如果学生自身有某些身体方面的疾病，比如心脏病、贫血、手脚受伤等，不适合剧烈运动，也承受不了这样的训练，所以对于这样的学生只需要他们提交一份医院的诊断证明就可以得到学校批准不用参加军训。
有些女同学可能正好赶上特殊时期，一般这样的最好提前跟教官说。如果是在训练期间开了先河，女生都用这个理由请假，教官也没法去核实，整个训练场地可能就会很混乱。
军训是大学第一次活动，还是尽量不要搞特殊化，实在身体状况不好的可以请假，否则还是不要糊弄，毕竟军训也是有学分的。