福建省的双一流大学分别有福州大学、厦门大学。福州大学是一所双一流院校、也是211大学、学校创建于1958年，是一所以理工为主的多学科的重点大学。厦门大学这所学校是由著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1921年创办的一所211，985大学。
2024年福建双一流大学共有2所，福建双一流建设高校名单如下：
| 序号 | 学校 | 双一流建设学科 |
| 1 | 厦门大学 | 教育学、化学、海洋科学、生物学、生态学、统计学 |
| 2 | 福州大学 | 化学 |
双一流大学建设，即建设建设世界一流大学和世界一流学科，推动一批高水平大学和学科进入世界一流行列或前列，是国家层面的一项重大战略决策，亦是中国高等教育领域继“211工程”、“985工程”之后的又一国家战略。
福州大学，简称福大，创建于1958年，是国家“211工程”重点建设高校，国家“双一流”世界一流学科建设高校，国家国防科技工业局、教育部与福建省人民政府共建高校，全国首批深化创新创业教育改革示范高校。“国家级大学生创新创业训练计划”、“百校工程”实施高校，福建省三所重点建设的高水平大学之一。
厦门大学由著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1921年创办，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，是国内最早招收研究生的大学之一，中国首个在海外建设独立校园的大学，被誉为“南方之强”。学校直属教育部，中央直管副部级建制，是综合性研究型全国重点大学。教育部、国家国防科技工业局、福建省和厦门市重点共建，是国家“双一流”世界一流大学建设高校。