日本国内大学众多，各具特色。根据不同的排名标准和侧重点，大学排名会有所变化。以下是根据2021年QS世界大学排名、泰晤士高等教育世界大学排名和日本国内的偏差值（一种衡量大学入学难度的指标），综合得出的日本国内三本大学排名表：
1.东京大学（TheUniversityofTokyo）
东京大学是日本最顶尖的大学之一，成立于1877年，位于日本首都东京。它在QS世界大学排名中位列第24位，泰晤士高等教育世界大学排名中位列第36位。东京大学以其卓越的研究成果和高质量的教育而闻名于世，特别是在自然科学和人文社科领域具有很高的声誉。
2.京都大学（KyotoUniversity）
京都大学成立于1897年，位于日本的历史文化名城京都。在QS世界大学排名中位列第38位，泰晤士高等教育世界大学排名中位列第54位。京都大学以其在科学研究方面的杰出成就而著称，尤其是在物理学、化学和生物学等领域。
3.大阪大学（OsakaUniversity）
大阪大学成立于1931年，位于日本的大阪市。在QS世界大学排名中位列第72位，泰晤士高等教育世界大学排名中位列第60位。大阪大学以其跨学科研究和创新教育而受到赞誉，特别是在工程学、医学和理学等领域。
4.东北大学（TohokuUniversity）
东北大学成立于1907年，位于日本的仙台市。在QS世界大学排名中位列第79位，泰晤士高等教育世界大学排名中位列第251-300位之间。东北大学以其研究实力和创新精神而著称，特别是在材料科学、机械工程和信息科技等领域。
5.名古屋大学（NagoyaUniversity）
名古屋大学成立于1939年，位于日本的名古屋市。在QS世界大学排名中位列第115位，泰晤士高等教育世界大学排名中位列第301-350位之间。名古屋大学以其高水平的教学和研究而受到国际认可，特别是在物理学、化学和生物学等领域。
6.九州大学（KyushuUniversity）
九州大学成立于1911年，位于日本的福冈市。在QS世界大学排名中位列第124位，泰晤士高等教育世界大学排名中位列第351-400位之间。九州大学以其创新精神和国际化程度而受到赞誉，特别是在工程学、医学和理学等领域。
7.北海道大学（HokkaidoUniversity）
北海道大学成立于1876年，位于日本的札幌市。在QS世界大学排名中位列第128位，泰晤士高等教育世界大学排名中位列第401-500位之间。北海道大学以其研究实力和教学质量而受到国际认可，特别是在农业科学、环境科学和生物学等领域。
以上排名仅供参考，具体选择哪所大学还需根据个人兴趣和未来职业规划进行综合考虑。