中医药大学中没有985和世界一流大学，但有六所高校入选双一流世界一流学科建设高校，其中北京中医药大学是211工程全国重点大学。一流学科名单如下：
1，上海中医药大学，一流学科：中医学、中药学。
2，北京中医药大学，一流学科：中药学、中西医结合、中医学。
3，南京中医药大学，一流学科：中药学。
4，天津中医药大学，一流学科：中药学。
5，成都中医药大学，一流学科：中药学。
6，广州中医药大学，一流学科：中医学。上海中医药大学。
| 名次 | 学校名称 | 全国排名 | 办学层次 |
| 1 | 北京协和医学院 | 30 | 世界知名高水平大学 |
| 2 | 海军军医大学 | 65 | 世界高水平大学 |
| 3 | 首都医科大学 | 72 | 中国一流大学 |
| 4 | 空军军医大学 | 77 | 世界高水平大学 |
| 5 | 哈尔滨医科大学 | 85 | 中国一流大学 |
| 6 | 中国医科大学 | 91 | 中国一流大学 |
| 7 | 北京中医药大学 | 93 | 世界高水平大学 |
| 8 | 陆军军医大学 | 105 | 中国一流大学 |
| 9 | 中国药科大学 | 107 | 中国一流大学 |
| 10 | 南方医科大学 | 110 | 中国高水平大学 |